Dem direkten Update von 10.4.11 auf 10.6 sollte nichts im Wege stehen, solange 10.6 von deinem Rechner unterstützt wird. Es wird aber empfohlen ein Sicherheitsbackup vorher zu erstellen, falls etwas beim Update schieflaufen sollte.
Probleme könnten aber entstehen, falls deine Festplatte noch mit MBR Partitioniert sein sollte.
Ich glaube, dass man das auch bei 10.4 im Fesplattendienstprogramm sehen kann. Dort muss wenn die Festplatte selber ausgewählt wird irgendwo GUID-Partitionstabelle oder so ähnlich stehen. Hauptsache GUID und nicht MBR.