Theoretisch sind bei 16GB und "stinknormaler" Nutzung nicht mehr die erforderlichen Gigabyte für das Update vorhanden.
OTA scheidet damit aus.
Bei noch 2,5GB frei vor Update auf 10.x gibt es 'zig Meldungen, dass danach "Schicht im GB-Schacht" war.
Via iTunes sollte es zumindest angeboten werden.
Nach dem DL kommt evnt. eine Fehlermeldung in der Art, dass nicht genügend Speicher auf dem Zielgerät für die Durchführung des Updates vorhanden ist. Keine Ahnung,warum das bei dir nicht so ist.
Sichere alle dir wichtigen Daten und probiere es über die Wiederherstellung mit iTunes.
Normalerweise wird bei dieser Aktion das aktuellste, verfügbare iOS automatisch verwendet und aufgespielt.
BackUp nützt nicht viel, weil unter 10.3.3 keine Sicherungen mehr zur Wiederherstellung angeboten werden, die mit 9.x gefertigt worden sind.