Hallo IEID,
das ist bei mir unter OS x 10.11.6 auch so: Alle Drittanbieter-Accounts sowie "Lokal" werden unterhalb der Intelligenten Postfächer aufgelistet, nicht aber die Apple-Accounts, die eingerichtet sind (...@me.com; ...@mac.com). Ob das schon immer so war, kann ich nicht sicher sagen, aufgefallen ist es mir vor einigen Tagen.
Da aber ganz oben unter Eingänge, Gesendet, Papierkorb usw. die einzelnen Postfächer aufgeführt sind, wäre es m.E. nicht wichtig, wenn diese Postfächer weiter unten erneut aufgeführt werden. Seit OS X 10.1. kann ich mich nicht erinnern, in den unteren Auflistungen zugreifen zu müssen, darum sind sie bei mir sogar standartmäßig ausgeblendet.
Gruß Thomas