Am besten hilft sicher, den Mac komplett neu aufzusetzen.
Zuvor rate ich zu einem sicheren Systemstart (mit gedrückter Shift-Taste), dass die HD mit dem Festplattendienstprogramm überprüfen oder reparieren und wenn da keine weitere Reparatur mit der Recovery-Partition nötig ist, die beiden Cache-Ordner in der User-Library und der allgemeinen Library entleeren.
Danach Neustart, Papierkorb entleeren und weiterarbeiten.
MacKeeper und ähnliches unnützes Zeugs entfernen (von einem solchen Programm dürfte auch die von Dir genannte Meldung stammen), zudem die Ordner Library -> LaunchAgents und –> LaunchDaemons auf mögliche Malware überprüfen kann ebenfalls nicht schaden.