Hi Eckart,
Eigene Vorlagen kannst Du auch wieder löschen, von Apple vorgegebene nicht. An den Ordnern lässt sich auch nichts verändern, grundsätzlich gilt (Zitat Apple):
"Eigene Vorlagen werden immer unter „Meine Vorlagen“ in der Vorlagenauswahl angezeigt. Du kannst Vorlagen nicht anders anordnen und du kannst keine Vorlagen löschen, die zu Numbers gehören."
Um eine eigene Vorlage (im Ordner Meine Vorlagen) zu löschen, einfach in Numbers auf das Menü Ablage und dort auf Neu... gehen, dann zum Ordner Meine Vorlagen, dann die zu löschende Vorlage mit einem rechten(!) Mouseklick aktivieren und die dann erscheinende Option Löschen wählen. Fertig.
Das funktioniert übrigens bei Keynote und Pages nach dem gleichen Muster.
Evtl. hilft Dir das ja weiter...