Seit dem Update werden PDF Files immer automatisch in Vorschau geöffnet

Hast Du einmal versucht, PDF-Expert neu zu installieren oder upzudaten?

Im Prinzip hast du alles richtig gemacht und MacOS sollte das Programm speichern, mit dem du die Dateien geöffnet hast. Vielleicht kann man mit dem Zurücksetzen des NVRAMs noch etwas bewirken (Macs ohne Apple-Chip): NVRAM auf einem Mac zurücksetzen - Apple Support (DE)

Ansonsten weiss ich nicht, ob irgendein Update-Programm eines Herstellers oder sowas noch dazwischen funkt, welches die Programmverknüpfungen irgendwie tangiert.

Das weiss ich nicht, da der Fragesteller ja den "PDF Expert" erwähnt hatte. Womöglich meinte er auch "PDF Export".

Wenn Einstellungen nicht längerfristig bleiben, kann es auch sein, dass die interne Batterie des Mac zur Neige geht. Das ist zumindest bei Windows-PC der Fall, die bestimmte Einstellungen verlieren, wenn man die Zeit/PC-Batterie raus nimmt, also die Knopfzelle. Ob und welche Batterien die Macs haben, muss man aber zuerst in Erfahrung bringen.

Ansonsten kann man auch ein Skript oder ein Automatorskript schreiben, dass bei jedem Start den Standard wieder herstellt, den man möchte.

Bei mir (Ventura) ist das Problem genau umgekehrt: Wenn ich eine PDF-Datei lade, öffnet sich Vorschau überhaupt nicht mehr und ich muss die Datei erst umständlich in den Downloads suchen. Das nervt genauso. Das "PDF Expert" habe ich nicht gefunden. Ist das ein extra Programm oder eine Einstellung im Betriebssystem?

PDF Expert ist ein PDF Programm, sogar einer der besten würde ich behaupten, komme nur hier drauf weil ich genau das gleiche Programm ohne Lösungsweg habe. es geht einfach darum das eine Software die als Standart ausgewählt ist, nicht als Standart fungiert und man immer über den öffnen mit weg gehen muss