Hi Wolge,
Ja, auch Daten von dritten Anbietern werden damit Ende-zu-Ende verschlüsselt. Apple sagt dazu folgendes:
Daten von Drittanbieter-Apps
In iCloud gespeicherte Daten von Drittanbieter-Apps werden immer verschlüsselt – sowohl bei der Übertragung als auch auf dem Server. Wenn du den erweiterten Datenschutz aktivierst, werden Daten von Drittanbieter-Apps, die in verschlüsselten Feldern und Assets in iCloud-Backup und CloudKit gespeichert sind, Ende-zu-Ende verschlüsselt.
Aus: Sicherheitsüberblick – iCloud-Daten - Apple Support (DE)
Gruß
Tobias