Hallo DieMimi,
dass die verschwundenen Nachrichten auch im Webmail nicht mehr vorhanden sind, ist hier ein wichtiger Hinweis. Damit würde ich ein reines Darstellungsproblem von Apple Mail zunächst ausschließen. Bei einem IMAP-Postfach werden Änderungen schließlich mit dem Mailserver und den anderen Geräten synchronisiert.
Ich würde jetzt möglichst wenig am Account verändern und zuerst die noch vorhandenen Nachrichten sichern. Auf dem Mac kannst du dazu in Mail das betreffende Postfach auswählen und über „Postfach > Postfach exportieren“ eine lokale Kopie anlegen.
Dass du die Passwörter bereits geändert hast, ist sinnvoll. Für die weitere Eingrenzung würde ich die neuen Passwörter aber nicht sofort wieder auf allen Geräten und in allen Mail-Programmen hinterlegen. Wenn möglich, die betroffenen Accounts zunächst auf den verwendeten Geräten deaktiviert lassen und anschließend einzeln wieder in Betrieb nehmen. So lässt sich eher feststellen, ob ein bestimmter Client die Änderungen auslöst.
Beim Firmenaccount würde ich die IT noch einmal gezielt bitten, nicht nur Regeln zu prüfen, sondern auch die Anmelde- bzw. Serverprotokolle zum ungefähren Zeitpunkt des Verschwindens. Interessant wäre insbesondere, ob dort ein IMAP-Zugriff oder eine Löschaktion eines bestimmten Geräts oder Clients nachvollziehbar ist.
Dass zwei Postfächer bei unterschiedlichen Anbietern betroffen sind, während andere Accounts offenbar unauffällig bleiben, würde mich zusätzlich nach einem gemeinsamen Nenner suchen lassen: Sind genau diese beiden Accounts beispielsweise auf demselben Mac, iPhone oder noch auf einem weiteren Gerät bzw. in einer anderen Mail-App eingerichtet?
Beim DomainFactory-Postfach würde ich außerdem möglichst zeitnah den Support kontaktieren. Für bestimmte DomainFactory-IMAP-Postfächer werden laut deren FAQ Backups sieben Tage lang aufbewahrt. Dabei kann allerdings nur ein komplettes Postfach auf einen früheren Stand zurückgesetzt werden. Deshalb unbedingt vorher die aktuell noch vorhandenen Mails sichern und eine Wiederherstellung mit DomainFactory abstimmen.
In Apple Mail würde ich ergänzend unter „Mail > Einstellungen > Accounts > Postfach-Verhalten“ kontrollieren, welches Serverpostfach bei dem betroffenen Account für „Gesendet“ ausgewählt ist. Ich würde dort aber vorerst nichts ändern, sondern die Einstellung nur prüfen.
Einen Account würde ich im Moment weder löschen noch neu einrichten. Erst wäre wichtig herauszufinden, wodurch die Nachrichten serverseitig verschwunden sind.
Zum Nachlesen:
Apple Support, Mail-Benutzerhandbuch, „Importieren oder Exportieren von Postfächern in Mail auf dem Mac“.
Apple Support, Mail-Benutzerhandbuch, „Ändern der Einstellungen im Bereich ‚Postfach-Verhalten‘ in Mail auf dem Mac“.
Beste Grüße & viel Erfolg 🌺