Hola Quechon!!
Comprueba si las fotos aún están en la carpeta "Eliminados recientemente" de la app Fotos del iPhone.
Normalmente, las copias de seguridad se sobre escriben, pero comprueba qué copias de seguridad tienes en iTunes del iPhone. En esta web de Apple: Localizar las copias de seguridad del iPhone, iPad y iPod touch - Soporte técnico de Apple, hay instrucciones para localizarlas.
Por lo de las fotos en cámara lenta y rápida, echa un vistazo a esta web de Apple: Mantener las fotos almacenadas de forma segura y actualizadas en todos los dispositivos - Soporte técnico de Apple. Pone:
Debes importar vídeos en cámara lenta y Time-Lapse mediante la aplicación Fotos o Captura de imagen en OS X Yosemite o posterior para que el efecto se sincronice vía iTunes. Al usar la Fototeca de iCloud, los vídeos en cámara lenta y Time-lapse conservan sus efectos.
Las Live Photos conservan su efecto al importarlas a Fotos en OS X El Capitan y versiones posteriores, pero lo pierden al sincronizarlas con el dispositivo a través de iTunes. Con la Fototeca de iCloud, las Live Photos conservarán su efecto independientemente del dispositivo que uses.
Quizás te interese activar la Fototeca en el iPhone y usar iCloud para Windows en tu PC.
Saludos!!