Hola,
Desconfigura e intenta registrar el Touch ID de nuevo o con otro dedo. Guíate por las recomendaciones de Obtener ayuda acerca de Touch ID en el iPhone o iPad - Soporte técnico de Apple
Si el problema persiste, lleva el dispositivo a una tienda Apple Store o a un proveedor de servicios autorizado de Apple, o ponte en contacto con el Soporte técnico de Apple.
Un saludo.