Eliminar Fusion Drive para tener los dos discos por separado?

Ok, lo malo es que si particionas un disco de 128Gb para meter Windows se te va a quedar en nada para uso de Mac OS, ¿has probado virtualizar?.

Piensa que perderás todos tus datos ya que hay que formatear el disco, si aún así estas dispuesto a hacerlo deberás crearte un pendrive usb del sistema para poder arrancar desde el o hacer un pendrive usb con la partición de rescate con la utilidad Recovery Disk Assistant.

Asistente de disco de Recuperación de OS X

Una vez que lo tengas hecho o uno del sistema para poder reinstalar arrancamos con la tecla "Alt" pulsada y elegimos el disco de recuperación o el usb creado para reinstalar, una vez en el instalador vete al Terminal y allí tienes que poner esto:

diskutil cs list

Con eso te enseñará los volúmenes lógicos en la estructura de tu equipo y necesitamos apuntar o copiar la del Logical Volume Group que es el que vamos a deshacer, en un grupo de números con este formato XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX. Una vez copiado tecleamos esto:

diskutil cs delete XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX

Donde las X son los números de tu UUID del volumen lógico. Una vez deshecho el volumen lógico de los 2 discos ya puedes salir de Terminal he ir a la Utilidad de Discos del mismo instalador para formatear a tu gusto los 2 discos y proseguir desde el mismo instalador tu instalación del tu sistema en el disco que desees.

Si tienes mas dudas me comentas pero creo que es fácil explicado así.