Hola jf2016,
Gracias por visitar las Comunidades de soporte de Apple en español. Te extiendo la más cordial bienvenida. Entiendo que después de hacer la actualización de Safari en tu MacBook Pro, has notado que las opciones de copiar y pegar no responden de la manera esperada. Me encantaría ayudarte con esta situación.
Empieza por arrancar tu MacBook Pro en modo seguro para verificar si el mismo problema ocurre en éste modo, lo cual te ayudará a aislar el problema para poder solucionarlo.
macOS Sierra: Arrancar en modo seguro
También te recomiendo que intentes utilizar tu computadora con una cuenta de usuario diferente para ver si este comportamiento continúa.
Configurar usuarios, invitados y grupos en la Mac
Después de verificar si el problema persiste en modo seguro, reinicia tu Mac mini normalmente y verifica si el problema persiste en arranque normal.
Un saludo cordial.