AFPS es la forma en la que se guardan los datos en el disco duro, en el soporte. Los datos en sí son los mismos.
Esos datos, esos documentos, los puedes seguir enviando a donde quieras como quieras, incluido mediante una carpeta compartida ya que protocolo de red es el encargado de transferir la información y cada ordenador leerá/escribirá la información como él esté configurado.
Por buscar un símil en el MundoReal, Si el disco duro es una habitación, el "formato" es el armario y los datos son la ropa. Apple ha cambiado el armario de un modelo HFS+ a uno con AFPS. La ropa que metes en él sigue siendo la misma pero se organiza de otra manera. Si le quieres dejar a un amigo una camiseta, tú la coges y se la mandas a tu amigo (por usb, por email o como quieras) y él la guardará en su armario modelo FAT32 (o lo que sea). Ni a ti te importa el modelo del armario de tu amigo y a tu amigo el tuyo.
La limitación es que el formato AFPS en sí, no es compatible con versiones anteriores del sistema. Lo que no se puede es formatear un disco duro en AFPS (o una memoria USB, que no sé si se puede formatear en AFPS) y luego ponerlo en otro ordenador con, por ejemplo, Sierra, no será reconocido porque Sierra no reconocerá ese disco duro como disco duro válido en el que leer o escribir nada.
Volviendo al símil... a tu amigo no le puedes dejar el armario a no ser que se haya comprado el manual de HightSierra, porque no sabrá como tienes organizada la ropa. ;-)
Es lo mismo que cualquier otro formato de disco duro: NTFS, FAT, etc... en Windows, Ext3, Ext4, etc... en Linux.
Sobre que hace con varios discos duros SSD en Raid no tengo ni idea. :-(