Hola!
Puesto que los tienes en todos los dispositivos, los tienes sincronizados con iCloud
No puedes eliminar de iCloud los libros, pero puedes ocultarlos.
Abre iBooks y en la barra de arriba (Barra de menús) Visualización-Ocultar libros de iCloud
Si quieres ocultarlos en todos los dispositivos abre iBooks y entra en la pestaña iBooks Store. Una vez dentro, en la barra de herramientas asegúrate que estás en la pestaña Destacados.
A la dcha de la página, en Enlaces pulsa en Comprado
y cuando se abra pulsa en Todo
Coloca el cursor en el libro que quieres ocultar y pulsa en el aspa que aparece arriba a la izquierda del libro. Te pedirá confirmación.
Así no aparecerán en ninguno de tus dispositivos
Un saludo