Hola jedavid82,
El problema quizá se deba a un conflicto entre la sincronización de las preferencias de Mail con tu cuenta de iCloud. Si utilizas iCloud Drive puedes verificar lo anterior haciendo la siguiente prueba:
- Cierra completamente la aplicación Mail si esta abierta, desde el menú Mail > Salir de Mail o con el atajo de teclas Command + Q
- Abre Preferencias del Sistema y en la sección de tu cuenta de iCloud, revisa si la opción de iCloud Drive esta activada, de ser así, haz click en el botón de Opciones... y desactiva la opción de Mail.app
- Abre la aplicación Mail y configura una firma de prueba.
- Cierra completamente de nuevo la aplicación y vuelve a abrirla para verificar que la firma de prueba se encuentre allí.
- Si tras ello verificas que la firma no ha desaparecido, cierra de nuevo la aplicación y vuelve a activar la opción de Mail.app en tu configuración de iCloud Drive en Preferencias del Sistema.
- Si todo ha salido bien, al volver a abrir Mail tu firma de prueba debería de permanecer.
Si no utilizas iCloud Drive, puedes probar con mover a tu Escritorio los archivos de preferencias de Mail, con extensión .plist, para que se vuelvan a reconstruir, estos se ubican en la carpeta oculta de Librería y para hacerlo, antes es recomendable contar con un respaldo de tu información importante, ya que el navegar entre sus directorios puede suponer un mayor problema si no se hace con cuidado. Habiendo creado una firma de prueba, cierra completamente la aplicación Mail y abre una nueva ventana del Finder, manteniendo presionada la tecla option elige el menú Ir para que se muestre el enlace a la carpeta oculta Librería, una vez abierta, navega por las siguientes carpetas: Mail > V5 > MailData > Signatures, en esta última estará el archivo con extensión .plist, mueve dicho archivo a tu Escritorio para mantenerlo resguardado. Una vez hecho, cierra todas las ventanas y aplicaciones y reinicia tu Mac para después probar el abrir Mail y verificar si la firma de prueba permanece. Si todo sale bien, puedes eliminar el archivo .plist de tu Escritorio, si el problema continuó, regresa el archivo de tu Escritorio a su carpeta de origen, reemplazando a aquel que se haya creado.
Espero que esta información te pueda ayudar a verificar el problema jedavid82, si no es mucha molestia, comparte con nosotros tus avances, recuerda que también puedes contactar al soporte técnico de Apple para recibir una mejor asesoría.
Saludos.