Hola Laustibideus
Primero, puedes reiniciar el iPhone X a ver si se soluciona el error.
Si después continua el problema, desinstala la aplicación desde Ajustes-General-Almacenamiento del iPhone. Puedes desinstalarla y conservará los datos que contiene, o hacer copia de los archivos que tienes en pdf y borrarla. Si puedes, bórrala para que se instale limpia. Vuelve a descargarla desde la App Store a ver si se soluciona el problema.
Te mando estos enlaces de Apple para ver si encuentras solución a tu problema. Ya sabes que puedes sincronizarlos con iTunes
Introducción a iBooks - META.TITLE
Si usas iCloud Drive, puedes acceder a los archivos ePub, libros de iBook Author y archivos PDF importados en todos los dispositivos.
Utilizar iBooks con documentos PDF en tu iPhone, iPad o iPod touch
Sincronizar y guardar archivos PDF
La primera vez que abras iBooks después de actualizar a iOS 9.3 u OS X 10.11.4, se te pedirá que uses iCloud. Obtén más información sobre la sincronización de tus libros y archivos PDF con iCloud.
También puedes añadir archivos PDF a la biblioteca de iTunes en el ordenador arrastrando y soltando el PDF en la biblioteca de libros de iTunes. Los archivos se mostrarán cuando prepares tu dispositivo para la sincronización. Si utilizas OS X Mavericks o posterior, arrastra y suelta los archivos PDF en la biblioteca de iBooks utilizando iBooks para Mac. Todos los archivos PDF o de iBooks de la biblioteca de iBooks están disponibles para su sincronización con tu dispositivo iOS a través de iTunes.
Para sincronizar un archivo PDF desde el ordenador con iBooks en el iPhone, el iPad o el iPod touch:
- Selecciona tu dispositivo iOS. (Obtén más información acerca de cómo sincronizar los datos con iTunes.)
- En Ajustes, haz clic en Libros.
- Selecciona Sincronizar libros.
- Si iTunes está configurado para sincronizar únicamente los libros seleccionados, comprueba que haya una marca de selección en la casilla situada junto al PDF que quieres sincronizar.
- Haz clic en Sincronizar.
También puedes usar iTunes para hacer una copia de seguridad de los archivos PDF. Para transferir archivos PDF al ordenador y realizar la copia de seguridad, transfiere las compras del dispositivo iOS al ordenador. Estos archivos no están en una copia de seguridad de iTunes. Obtén más información acerca de lo que contienen las copias de seguridad de iTunes y iCloud.
Un saludo