Hola davidtinoco
Necesitamos mas información sobre tu iPhone, sisema y como haces la copia de respaldo del Whatsapp, es importante para poder ayudarte mejor en tu problema pues si no haces copia de seguridad en iCloud y en ella incluyes Whatsapp o en sus servidores no podrás recuperar las conversaciones, eso esta en Whatsapp > Configuraciones > Respaldo de chats.
Esperamos nos indiques esta información para ayudarte.
Un saludo.