Hola cristhiandealajuela,
De momento, todo funciona de maravilla. En lo personal, cuando se encuentra disponible una actualización tan robusta como lo es el pasar de una versión de iOS a otra, de la 11 a la 12 en este caso, realizo la actualización a través de iTunes, ya que así me aseguro de descargar y reemplazar todos los archivos que corresponden a dicha actualización. Vía OTA, uno obtiene los archivos necesarios para la actualización sin necesidad de reemplazarlo todo, por lo que la descarga e instalación puede ser un tanto más rápida. Ya en futuras actualizaciones dentro de la versión de iOS 12, lo haré probablemente vía OTA. Al final, es más una cuestión de preferencia.
Es cierto si, que a través de la actualización por iTunes uno puede estar más seguro de evitar algún fallo repentino en la actualización, pero esto no ocurre en la totalidad de las veces, ya que un problema con nuestra conexión a internet puede también provocar una descarga incompleta de la actualización. Por ello, es importante el mantener un respaldo de nuestra información para evitar así llegar a pasar un mal momento (Cómo actualizar a iOS 12 - Soporte técnico oficial de Apple).
Saludos, espero que disfrutes también de iOS 12 🙂