Bonjour Fabfil77700 et bienvenue sur les Communautés d'assistance Apple !
C'est plutôt bien embêtant cette perte de fichiers PDF sur votre iPad Pro, cependant bien vu pour le réflexe de restauration d'une sauvegarde auquel vous avez pensé !
Vu que cela n'a rien donné, il est probable que les fichiers PDF en question ne fassent pas partie de la sauvegarde sélectionnée ; ou bien qu'ils soient stockés avec iCloud Drive :
La première fois que vous ouvrez iBooks après la mise à jour vers iOS 9.3 ou OS X 10.11.4, vous êtes invité à utiliser iCloud. Si aucun message ne s’affiche, il vous faudra peut-être configurer iCloud Drive.
Vous pouvez utiliser iBooks et iCloud Drive pour synchroniser les livres ePub et iBooks Author, ainsi que les fichiers PDF, de façon à pouvoir y accéder sur tous vos appareils. Une fois que vous avez activé iCloud Drive, tous les fichiers se chargent automatiquement sur iCloud.* Tous les livres ePub et iBooks Author et tous les fichiers PDF que vous ajoutez à votre bibliothèque iBooks par la suite se chargent automatiquement sur iCloud.
Avec iOS 11, c'est désormais l'app Fichiers qui regroupe cela ; n'hésitez donc pas à jeter un oeil dans l'app Fichier > iCloud Drive :
Disponible sous iOS 11, l’app Fichiers rassemble tous vos fichiers. Vous pouvez facilement parcourir, rechercher et organiser tous vos fichiers au même endroit. Et cela ne s’applique pas seulement à ceux que vous avez enregistrés sur l’appareil que vous utilisez, mais aussi à ceux sauvegardés dans les apps, sur vos autres appareils iOS, dans iCloud Drive et sur les autres services dans le nuage.
Retrouvez dans le lien suivant, toutes les informations utiles sur l'Utilisation de l’app Fichiers sur votre iPad.
Bonne journée à vous !