Les sauvegardes Time Machine sont des sauvegardes de ce que tu as actuellement sur ton Mac, donc tu ne risque rien à supprimer quoi que ce soit, tant que tu ne supprimes rien du Mac lui même.
Si tu veux plus d'information ce qu'est une sauvegarde Time Machine, et comment ça marche, regarde cet article: Utilisation de Time Machine pour sauvegarder ou restaurer les données de votre Mac - Assistance Apple
Time Machine fera toujours des sauvegardes intégrale du disque dur de ton Mac, sauf si tu exclus certaines choses (regarde dans l'article plus haut pour plus d'info). Donc même s'il y a des choses que tu ne veux pas dessus, pour la plupart tu ne pourras rien y faire. Time Machine sert au cas où il arrive quelque chose à ton Mac, ce n'est pas pour stocker tes données.