Olá Dani16.
O backup é uma cópia de segurança. Apagá-lo apenas elimina a esta cópia. Um novo backup deve ser feito posteriormente para garantir que você não tenha surpresas futuramente, mas se já não há espaço provavelmente você não conseguirá fazer um novo backup, pois seu aparelho já armazena mais dados que o iCloud pode suportar. Confira em: ajustes/geral/armazenamento e iCloud.
Talvez seja o caso de adquirir mais espaço no iCloud ou passar a fazer o backup no seu computador.
Att,