Opa, bom dia!
Então, somente após a atualização para o Mac OSX Sierra isto passou a acontecer?
Acredito que seu aparelho vem já atualizando desde sua aquisição e imagine que cada atualização cria uma camada adicional em sua memória de armazenamento (ROM), isto o coloca em uma espécie de "sobrecarregamento nos caminhos do OS", é necessário que sejam feitos alguns procedimentos para limpar tais caminhos. Primeiro; Como redefinir a NVRAM no Mac - Suporte da Apple após (caso persista); Redefinir o Controlador de Gestão do Sistema (SMC) no Mac - Suporte da Apple , e, por fim, caso não sejam efetivos tais procedimentos, seria necessária uma formatação da maquina, ou seja, apagar tudo da memória ROM e uma nova instalação.
Antes da reinstalação, se preferir, poderá também tentar recuperar o disco, segundo a pagina: Disk Utility para Mac: Reparar um disco em um conjunto de discos utilizando o Utilitário de Disco
IMPORTANTE: Faca BACKUP de seu aparelho; Usar o Time Machine para fazer backup ou restaurar o Mac - Suporte da Apple
E para a formatação do dispositivo pode seguir a pagina: Como reinstalar o macOS - Suporte da Apple na parte "Apagar disco" se caso for necessário.