Boa noite Gési,
O espaço que você comprou é para sua nuvem. Ela não serve para aumentar a capacidade do seu iPhone. O WhatsApp continuará usando espaço do seu iPhone, assim como todos os demais aplicativos. Se você está com espaço reduzido, delete os aplicativos não utilizados, faça uma limpeza de arquivos de fotos e videos recebidos no WhatsApp e otimize o armazenamento das fotos da Fototeca do seu iCloud. O artigo Fototeca do iCloud - Suporte da Apple traz informações sobre esse procedimento de otimização.
Espero ter ajudado!
Atenciosamente,
Felipe Lapolli