Olá, Sandrobenshalom,
Não posso te afirmar com 100% de certeza mas acredito que se os dados dos aplicativos fossem para o backup, aumentaria de forma estrondosa o tamanho do backup.
E até onde sei, as informações dos apps contidas no backup são, somente, quais estão instalados no seu dispositivo. Dessa maneira, quando você restaura o backup ele identifica quais são os apps que foram "migrados" pelo backup e faz o download novamente.
Basta acessar a App Store a mandar baixar todos os apps novamente.
Boa sorte 🙂