Olá JGMachado, creio que isso acontece porque provavelmente suas fotos estão armazenadas no iCloud.
Vá em Ajustes > iCloud > Fototeca do iCloud e veja se a opção "Otimizar no iPhone" está marcada.
Caso esteja marcada isto significa que algumas de suas fotos estão sendo enviadas para o iCloud para guardar espaço.
Para corrigir isso você pode selecionar a opção "Transferir e manter" e terá as fotos disponíveis no iPhone e no iCloud.
Obter ajuda com a Fototeca do iCloud - Suporte da Apple
Espero ter ajudado