Oi Ana,
Essa mensagem pode aparecer basicamente por 4 motivos: que o acessório realmente não seja compatível com seu aparelho, que o acessório esteja danificado, que o acessório não seja certificado pela Apple ou que a entrada do fone esteja suja ou danificada.
Veja o que diz esse link a seguir, sobre como proceder nesses casos: Se você vir o alerta "O acessório pode não ser compatível" - Suporte da Apple
Boa sorte