Olá DaniPSouza,
Então, como as manchas apareceram depois da tela ser trincada, eu acho que você não poderá fazer uso da garantia para o problema das manchas, já que existe uma possibilidade de que sejam decorrentes da tela trincada, pelo menos é o que eu acho.
De qualquer maneira se a tela fora trocada creio que provavelmente o problema das manchas também se resolverá.
Esse link informa critérios e preços do reparo da tela: Critérios de preços de serviço para iPhone – Suporte da Apple
E para encontrar uma autorizada no Brasil use esse link: https://locate.apple.com/br/pt/
Espero ter ajudado