Oi Rita
sim toda vez que você apagar uma foto do seu iphone ele vai apagar no iCloud
da uma olhada nesses artigos. Apagar fotos do iPhone, iPad e iPod touch - Suporte da Apple
Porém se o que você quer é economizar espaço do iPhone usando o iCloud, veja esse trecho que copiei de um artigo da Apple abaixo.
Armazenar fotos e vídeos no iCloud
As fotos e vídeos ficam armazenados no dispositivo no formato original e em alta resolução. Isso significa que ocupam muito espaço no iPhone, iPad ou iPod touch. Com a Fototeca do iCloud, você consegue liberar mais espaço no dispositivo e acessar sua coleção não importa onde esteja.
Como usar a Fototeca do iCloud:
- Toque em Ajustes > [seu nome] > iCloud > Fotos. Se estiver usando o iOS 10.2 ou anterior, toque em Ajustes > iCloud > Fotos.
- Ative a Fototeca do iCloud.
- Selecione "Otimizar no iPhone" para liberar espaço no dispositivo.
Com a opção "Otimizar Armazenamento", as fotos e vídeos menores e que ocupam menos espaço são mantidos no dispositivo, mas as versões originais e em alta resolução são armazenadas no iCloud. Você pode armazenar no iCloud quantas fotos e vídeos quiser, desde que ele tenha espaço suficiente.
Fonte: Gerenciar o armazenamento de fotos e vídeos - Suporte da Apple
Espero ter ajudado