Por que o iCloud Drive apagou os arquivos que estavam salvos no Macbook?

Gostaria de saber por que o iCloud Drive apagou os arquivos que estavam salvos no macbook? Uma vez que foi a partir do mac que upei os arquivos para a nuvem e depois não estavam mais lá, necessitando baixar novamente todos os arquivos. Como faço para deixar salvo direto e como faço para baixar uma pasta de uma vez, ao invés de só baixar os arquivos abrindo? Não achei outro meio de baixá-los, tanto no Macbook quanto no iPad.