Boa tarde rafaelgome,
Para usar como Time Machine, o formato do sistema de arquivos precisa ser do Mac, portanto você não conseguirá ler os arquivos em Windows. Se tiver em formato Mac, você pode usar sim o espaço remanescente para colocar outros arquivos. Se quiser usar em ambos os computadores você tem que usar no formato ExFAT, mas ai o Time Machine não poderá ser usado nesse sistema de arquivos. O artigo Disk Utility (El Capitan): Partição de disco físico vai lhe ajudar mais sobre esse assunto.
Espero ter ajudado!
Atenciosamente,
Felipe Lapolli