In einem Fotoformat wie JPEG oder auch im HEIF können Bearbeitungen nicht abgespeichert werden, dass geschieht auf Basis von PNG.
Diese PNG Kopie wird in einem Cache unter System gespeichert, aus diesem Grund wird das unter Speicherplatzbelegung angezeigte System mitunter sehr groß. Die Historie, bzw. die Änderungen werden wohl so oder so nach einer gewissen Zeit vollständig übernommen, dass Original wird ersetzt, die Arbeitskopie gelöscht.
Mit Einbindung der Cloud geschieht das so nicht ohne weiteres, die Dublette bleibt erhalten... Theoretisch. ;-)
Unter iOS 11.3.1 wird jetzt wohl die Arbeitskopie im Cache schon nach kurzer Zeit verworfen ohne getätigte Bearbeitungen in Fotos fest zu übertragen.
Wie und warum das weiß sicherlich nur eine Handvoll Experten von Apple, gemesssen an den ganzen Macken in iOS, vielleicht auch nicht. :-D
Nochmal: Kopierst Du ein Bild in iOS Dateien, wird der IST-Zustand kopiert, dass so exportierte Bild kann nicht zurückgesetzt werden! Sicherst Du aus Dateien zu Fotos zurück, ist das die neue Kopie deines Originals.
Soweit mit oder ohne Upload.
Das mit Drittanbieter Apps wundert mich!
Welche verwendest Du, wenn man fragen darf?
Drittanbieter Apps sind Normalerweise davon komplett unabhängig, diese Apps kopieren sich ja das Bild ein und bearbeiten dieses in sich, wolltest Du dann das Original unter Fotos ersetzen, wirst Du doch explizit gefragt.
Es gibt auch Einstellungen dazu, wie welche App auf Fotos zugreifen darf, also read und write Berechtigungen.
Auf den temporären Cache hast Du unter normalen Umständen keinerlei Zugriff.
Ist das WiFi ein Heimnetzwerk?
Vielleicht einmal einen Speedtest durchführen und schauen ob sich das Ergebniss mit der Soll Bandbreite deckt, ansonsten optimieren oder neu einrichten, ggf. einen Repeater einbetten wenn es im Haus Funklöcher gibt. Aber nun gut, dass wurde, wenn, dann sicherlich schon alles so oder so gemacht. :-)