Offenbar muss er genau sitzen, damit er lädt und man kann sich nicht darauf verlassen, dass ein magnetisches Anklippen dafür sorgt, dass er lädt. Ich hab das bei mir auch beobachtet. Angeklippt, lädt von 3% an. Eine Stunde später war er bei 14%.
Stift abgenommen noch mal angeklippt und man konnte ihm beim Laden schön zusehen, wie die Prozente nach oben klettern.
Das beste ist, man klippt ihn an und schaut kurz auf die Batterieanzeige (habe ich als Widget hinzugefügt). Lädt der Stift zügig, sitzt er gut. Dann sollte man aber in der Zeit nicht mit dem iPad herumspielen oder es herumtragen, damit der Stift nicht wieder verrutscht.
Ähnliches hab ich manchmal bei der Apple Watch. Man glaubt sie lädt auf ihrem Ladedock und wenn man sie nach zwei Stunden abnimmt, hat sie entweder gar nicht oder nur wenig geladen, weil sie nicht richtig auf dem induktiven Dock lag.