Da lässt sich nichts daran ändern. Fotos erkennt eine wiederhergestellte Mediathek nicht als die Mediathek, die schon in iCloud ist. Wenn Zweifel besteht, ob alle Fotos in der Mediathek schon in iCloud sind, lädt Fotos diese alle nochmal hoch, um sie mit der bestehenden iCloud Mediathek abzugleichen. Dabei werden aber normalerweise keine Duplikate in iCloud erzeugt. Fotos prüft auf Duplikate. Das erneute Hochladen passiert beispielsweise, wenn du eine Mediathek auf ein anderes Laufwerk verschiebst, wenn du sie vom backup restaurierst, wenn du zwischen zwei Mediatheken als Systemfotomediathek wechselst. Aber leider auch, wenn wir eine Mediathek reparieren.
Falls die Mediathek in iCloud vollständig ist, kann es günstiger sein, eine neue, leere Mediathek anzulegen und diese zur iCloud Fotomediathek zu machen, anstatt die Mediathek vom Backup zu restaurieren. Dann hat man nur den Aufwand, alle Fotos aus iCloud herunterzuladen, erspart sich aber das lange Hochladen der wiederhergestellten Mediathek.
Um die fehlenden, neuesten Fotos aus der restaurierten Mediathek zu importieren, müsstest du dann die vom backup restaurierte Mediathek kurz in Fotos öffnen, aber nicht als iCloud Fotomediathek. Exportiere die neueren Fotos in einen Ordner und importiere sie dann in die neu angelegte iCloud Fotomediathek.