Apple hatte zu diesem Thema früher einen eigenen Support Artikel, der aber aus irgendeinem Grund zurückgezogen worden ist. Jetzt findet man ihn nur noch im Internetarchiv mit der Wayback Machine: https://web.archive.org/web/20190505212533/https://support.apple.com/en-us/HT204968
"Using third-party apps to remove duplicate photos might damage your Photos for macOS library
Apple recommends that you avoid using certain third-party apps that can damage your photo library on your Mac.
Some third-party apps for your Mac that claim to clean, shrink, de-clutter, or remove duplicates from Photos can instead damage your photo library or delete pictures and related data.
You can avoid damage to your library by organizing and managing your pictures from within Photos"
Kurz gesagt hat Apple immer vor Programmen gewarnt, die Duplikate aus der Fotosmediathek entfernen, weil eben einige davon nicht die vorgesehenen Schnittstellen zur Mediathek verwendet haben und dabei die Mediatheken unrettbar zerstört haben.
Nur wurden in diesem Dokument nicht Ross und Reiter genannt, sondern alle Programme über einen Kamm geschoren, vielleicht waren es rechtliche Gründe, warum einzelne Programme nicht genannt werden durften. Einige Programme sind ja sicher zu benutzen, die nicht direkt die Mediathek von aussen modifizieren.