Hola LeoGuz
El problema de los videos que comentas, a mi también me pasa con Safari y los vídeos de YouTube. Si bien es cierto que me pasa al revés que a ti. Con macOS High Sierra me pasa menos, en cambio con las fotos de las web con interrogación, me pasa a menudo. Y no me pasa con otros navegadores como Chrome.
Lo que nos cuentas del parpadeo, se pueden intentar algunas cosas, si bien es cierto que no parece que te pase de continuo, o en una franja determinada de la pantalla, pero prueba lo que te escribo a continuación.
Puedes intentar reiniciar el Mac en Modo seguro a ver si el problema persiste
Utilizar el modo seguro para aislar los problemas en el Mac - Soporte técnico de Apple
También es posible que el problema se deba a algún defecto o error del controlador de administración del sistema.
El SMC regula muchos principios básicos del Mac.
Puedes restablecerlo a ver si soluciona tu problema
Cómo restablecer el controlador de gestión del sistema (SMC) del Mac - Soporte técnico de Apple
Si no funciona, creo que lo siguiente es que le hagas un Apple Hardware Test a ver si te marca algún error.
Cómo usar Diagnóstico Apple en el Mac - Soporte técnico de Apple
Lo siguiente es que, ya sea que te marque algún error o que no lo puedas arreglar con ninguno de los pasos recomendados en los enlaces, te pongas en contacto con Apple para que te ayuden.
Contacto - Soporte técnico oficial de Apple
El problema de llevarlo a Apple, es que si el parpadeo te sucede de vez en cuando, es fácil que no pase cuando estás allí. Por lo que te recomiendo que, si puedes, grabes con el móvil el momento en el que sucede, si es que te da tiempo.
La verdad es que no sé si ese pequeño parpadeo es para tenerlo en cuenta. Obsérvalo por si va a más o en que situaciones te ocurre.
Los enlaces que te he mandado, no comprometen en absoluto el funcionamiento del Mac, en caso de que quieras hacer lo que te indican. No te preocupes. Puedes hacerlo sin problema
Un saludo