Porque se pausan las canciones al entrar a whatsapp otra app y escribir

¿Eso puede ser porque actives el micrófono o pongas a reproducir algún vídeo/sonido en whatsapp?. O tengas algún teclado personalizado que haga esas cosas...

En sí Whatsapp no debería interferir, en realidad ninguna aplicación interfiere en la música a no ser que haga uso de la misma.

Excepto notificaciones, que bajan el volumen de la música.