Hola,
digamos que hay que tener algunas cosas en cuenta, entre otras que ambos dispositivos estén conectados a la misma ID; luego que ambos dispositivos estén actualizados a sus últimas versiones, tanto de iOS en el iPhone como macOS en el Mac que tengas, y este enlace te explica un poco el proceso:
https://support.apple.com/es-es/HT209236
Pero en este punto de los ajustes es lo que tienes que tener en cuenta:
Cambiar los ajustes
Para sincronizar el contenido de Apple Books en todos tus dispositivos, primero debes activar iCloud Drive: en el menú en la parte superior de la pantalla del ordenador, selecciona menú Apple () > Preferencias del Sistema. Haz clic en iCloud y selecciona iCloud Drive. A continuación, abre la app Libros y selecciona Libros > Preferencias en el menú en la parte superior de la pantalla del ordenador. Después, selecciona “Sincronizar colecciones, marcadores y resaltados entre dispositivos”.
Elige Libros > Preferencias para cambiar otros ajustes de Apple Books, como las Descargas automáticas y los Controles parentales.
Un saludo y suerte!