Abgefahren, PDF ohne Transparenzen und trotzdem diese Probleme.
Was bin ich froh noch auf El Capitan zu sein.
Hier der Link zur Feedbackseite. Glaube nicht, dass sich das jemals jemand wichtiges bei Apple durchliest. Ansonsten müsstest du dich beim Bug Reporting anmelden (siehe hier). Das dürfte eher Gehör finden.
Ansonsten, so meine Erfahrung bisher, exportiere ich die 4C Layouts immer als RGB PDFs für die Kunden, da diese eigentlich nie einen entsprechend kalibrierten Monitor haben um die Farben korrekt zu prüfen. Sofern sie es vorher "korrekter" sehen wollen, müssen sie entweder zu mir kommen oder wir bestellen einen Proof (immer die sicherste Variante).
Für Laien sind die RGB Darstellungen dann auch besser, weil die Farben "nicht so flau" sind … Laien halt.