Hallo Lothar,
grundsätzlich als Beantwortung zu Deiner Frage:
Bei einem Backup wird alles gesichert einschließlich Mist und anschließend auch wieder zurückgespielt. Das System überprüft nicht, sondern sichert. Ansonsten gilt, was Dir Enfant Terribel bereits geschrieben hat.
Zu Deinem Problem:
Ich würde mal alle laufenden Apps totschlagen/ rauswischen und anschließend das Handy neu starten. Wenn Dein "jetziges Handy" das 6s ist, wurden vermutlich schon einige iOS-Updates OTA gemacht. Es würde sich da sicher mal lohnen, ein iOS-Upgrade via iTunes ohne Löschen Deiner Daten zu machen.
Viel Erfolg ervau