Du hattest wohl mal Amazon Music installiert und das sind Reste davon. Es kann sein, dass die das Herunterfahren verhindern. Mit "Clean up" ist gemeint, dass du diese Dateien löschen sollst. Angegeben ist jeweils der komplette Verzeichnispfad, also:
~/Library/LaunchAgents/com.amazon.music.plist
/Applications/Amazon Music.app/Contents/MacOS/Amazon Music Helper
Die findest du ganz einfach: Finder öffnen, "Gehe zu..."-->"Gehe zum Ordner..." und jeweils einfach den kompletten Dateipfad in das Dialogfenster kopieren. Dann landest du genau bei der zu löschenden Datei, das ist einmal "com.amazon.music.plist" und die andere "Amazon Music Helper". Beispiel für den ersten Pfad:

Der anschliessende sichere Systemstart ist dazu gedacht, dein System etwas aufzuräumen, insbesondere temporäre und cache-Dateien zu entfernen. Danach sollte er wieder vernünftig laufen.