Hola ricardo188!!
En esta web de Apple: Calibrar el Apple Watch Series 1 o posterior para obtener una mayor precisión en Entreno y Actividad - Soporte técnico d…, aparece que borrar los datos de calibración ayuda a calibrar el Watch para una mejor medición, pero no advierte de que se pueden borrar datos, por lo que entiendo que no ocurrirá. Entiendo que el borrar los datos de calibración es como hacerle un reset a los sensores, pero que no afectará a los datos que ya tengas guardados.
Ya nos contarás que tal te ha ido.
Saludos!!