Hola Debafer
Supongo que tienes los 5GB de espacio de almacenamiento de iCloud, que te regala Apple. Esos 5GB son por cada cuenta (por cada ID de Apple, vamos), no por cada dispositivo.
Si no se respalda nada en el iPhone, pero si en el iPad, es posible que, o bien no tengas espacio, (ya sea en el dispositivo o en iCloud), o no tengas los servicios de iCloud activados en el iPhone.
iCloud: Activar o desactivar iCloud y sus apps
Con respecto a como importar las fotos a tu PC, para poder luego borrarlas del iPhone, te dejo este enlace para que elijas como hacerlo.
Transferir fotos y videos desde tu iPhone, iPad o iPod touch - Soporte técnico de Apple
Cuando transfieras los archivos que necesitas respaldar, ya puedes borrarlos del iPhone o de cualquier otro dispositivo sincronizado con iCloud. No los borres antes, porque se borrarán de todas partes.
Un saludo