Si, la activación con tu ID se pudo hacer correctamente, pero si no es un dispositivo nuevo se corre el riesgo igualmente.
La forma de saber si tu iPhone no es nuevo sería restaurándolo con iTunes en un ordenador. Primero haces una copia de seguridad, que después le podrás restaurar. Si hay algún problema de seguridad, aparecerá con la restauración.
Aunque ya te digo, yo iría a la tienda y pediría explicaciones. Si no me dieran razones coherentes, pediría la devolución de mi dinero.
Saludos!!