Hola ntlmrz,
Bienvenido a las Comunidades de soporte de Apple en español. El método que mencionas es efectivamente, una forma de cambiar el formato de archivos de tu disco. Antes de continuar, me gustaría recomendarte ampliamente el que realizarás un respaldo apropiado de tu información, especialmente en un disco externo si te es posible.
Si ya verificaste que el formato de archivos que tiene tu disco actualmente no es APFS, es probable que al estar siendo utilizado, montado, no puedas hacer el cambio, incluso desde el modo de recuperación. En este caso puedes volver a intentarlo empleando el modo de recuperación desde Internet, manteniendo presionadas las teclas comando + option + R, o bien, si dispones de una USB de, al menos, 12 GB, puedes crear un instalador ejecutable para macOS (aprovechando en crear uno con macOS Catalina), y usarlo para entrar a la Utilidad de Discos del instalador y desde allí hacer la prueba de cambiar el formato del disco de tu Mac.
Si el problema continua, teniendo en cuenta que has creado un instalador ejecutable de macOS Catalina y si dispones del respaldo de tu información. Otra opción que tienes para actualizar tu Mac a macOS Catalina podría ser la de instalarlo desde cero, usando el instalador ejecutable para borrar todo tu disco para seleccionar posteriormente el formato APFS (Cómo borrar un disco para Mac - Soporte técnico de Apple).
Espero que esta información te resulte de utilidad ntlmrz, cuéntanos, por favor, tus avances o si tienes alguna duda al respecto, mis compañeros y yo con gusto trataremos de ayudarte, también, no dudes en contactar al soporte técnico de Apple si deseas una mejor asesoría.
Saludos :)