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Hola, alvaro1289:

Si ambos se sincronizan por iCloud, sí se borrará. Puede tardar unos minutos, hasta que se sincronice. Te saldrá un aviso si es así.

Si deseas conservarla en el Mac, puedes exportarla antes (o desvincular la fototeca de iCloud).

Hola, alvaro1289:

En Fotos del Mac selecciona las fotos deseadas, y en el menú Archivo tienes la opción para exportarlas. Seleccionas el formato deseado, y en el siguiente paso te preguntará dónde quieres guardarlas.

En Preferencias puedes desvincular de iCloud, pero tendrás que importar manualmente las fotos que te interesen.

Otra opción es crear otra fototeca, desvinculada de iCloud, pero es mucho jaleo ir cambiando de fototeca.

Saludos.