Bonjour alia288 et bienvenue dans la Communauté Apple !
Pour savoir ce qui peut être fait, il va falloir isoler l'origine du problème.
Lorsque tu effaces un e-mail sur ton iPhone et que tu te rends sur le site internet de ton fournisseur de mail, est-ce que le message a disparu ?
De la même manière, si tu effaces un e-mail sur le site internet, s'efface-t-il aussi de ton iPhone ?
Si tu utilises un VPN, je te conseille de le désinstaller et de refaire un test. N'oublie pas de le réinstaller si tu le souhaites.
Si ton compte est configuré en IMAP (demande à ton fournisseur si tu n'en es pas sûr), tu peux le supprimer depuis Réglages > Mail > Comptes puis l'ajouter de nouveau.
Tiens-nous au courant et passe une bonne journée !