Bonsoir StephaneWeber,
Essayez de vider la corbeille des messages déjà supprimés de votre iPhone :
Ouvrir l’App Messages, touchez Filtres en haut à gauche, touchez Suppressions (la corbeille) et Tout supprimer en bas à gauche (ou sélectionnez les messages que vous souhaitez définitivement supprimer).
Pour le nombre de Messages il faut prendre en compte qu’une même conversation compte plusieurs messages. Par exemple, si vous conservez une conversation avec une personne pendant une année (soit 365 jours) et que vous échangez un message et une réponse par jour alors ça compte pour 730 messages pour une conversation. En fait, une conversation comporte plusieurs messages.
Voir « Supprimer définitivement des messages et pièces jointes supprimés récemment » :
Supprimer des messages et des pièces jointes dans Messages sur l’iPhone - Assistance Apple (FR)
Le reste du guide indique également d’autres modifications possible dans l’App Messages.
Cordialement.