Sim, tem, mas muito pouco.
A porcentagem tem a ver com a capacidade de a bateria reter sua carga na quantidade original, que é monitorada por este recurso do iOS chamado Saúde da Bateria.
Jogos consomem bastante energia e, por consequência, fazem com que ela precise ser carregada mais vezes, e quanto mais você der cargas, mais ela será usada e perderá capacidade de reter energia. Isto é normal em qualquer bateria.
Não se preocupe com isso, pois a situação sempre foi esta mesmo antes de existir o recurso. Enquanto a sua utilização não for prejudicada por mudanças drásticas, nem esquente com estes números.
Com o tempo você talvez experimento quedas bruscas na porcentagem de carga, na duração da bateria, alguma perda de performance, etc. Neste momento você deve se preocupar em trocar a bateria. Fora isso, desencane desta porcentagem e utilize seu iPhone da maneira que melhor lhe atender.