Hola lucia187,
Gracias por visitar las Comunidades de soporte de Apple en español.
Si bien entiendo, estás teniendo un problema al acceder a tus libros por medio de la app de iBooks en tu iPad mini. Me encantaría ofrecerte algunos pasos que pueden ayudarte con esta situación.
Antes que nada, ya que nos comentas que tu iPad esta utilizando en este momento el sistema iOS 9.3.5, te invito a que revises si tu dispositivo puede actualizarse a alguna versión más actualizada. Puedes usar el siguiente enlace para buscar actualizaciones:
Actualizar tu iPhone, iPad o iPod touch
El siguiente enlace es posible que te sea útil:
Introducción a iBooks
Presta atención a la siguiente sección:
Antes de acceder a los libros y audiolibros en todos los dispositivos, asegúrate de haber iniciado sesión en todos ellos con la misma Apple ID.
Los libros que compras en iBooks Store están disponibles automáticamente en la app iBooks en todos los dispositivos. Los audiolibros que compras en iBooks Store o iTunes Store están disponibles automáticamente en la app iBooks en un iPhone, iPad o iPod touch con iOS 9 y posterior, y en iTunes en una Mac con iTunes 12.4 o posterior.
Si usas iCloud Drive, puedes acceder a los archivos ePub, libros de iBook Author y archivos PDF importados en todos los dispositivos.
También puedes sincronizar manualmente audiolibros que no compraste en iTunes Store mediante iTunes y un cable USB.
Si formas parte de Compartir en familia, puedes compartir contenido que compraste con otros miembros de tu familia.
También te recomiendo que revises la velocidad de tu conexión de internet y si puedes conectarte a alguna red diferente para observar si encuentras alguna diferencia.
Saludos cordiales.