Hola xavi6!!
Si iMovie solo reconoce esa cantidad de fotos, es posible que sea por que el resto no sean compatibles. Puede que sean Live Photos, o fotos en modo retrato, o capturas de pantalla, etc.
Si quieres saberlo con seguridad, contacta con el soporte técnico de Apple para obtener ayuda. Desde este enlace puedes hablar con ellos: Contactar con el Soporte técnico de Apple. Escoge tu región en la zona inferior de la página.
Y aquí: Ponerse en contacto con Apple, están los teléfonos del soporte técnico de Apple en todo el mundo. Llama al más cercano a tu región.
Ya nos contarás que tal te ha ido.
Saludos!!